Ses différentes activités professionnelles l'ont amené à travailler avec Maurizio Arena, Serge Baudo, Maurizio Benini, Roberto Benzi, Jean-Claude Casadesus, Claus Peter Flor, Eliahu Inbal, Jacques Mercier, Marc Minkowski, Evelino Pidò, Michel Plasson, Yutaka Sado, Pinchas Steinberg...
Professeur de la classe de chant choral puis directeur du conservatoire Léo Delibes de Clichy dans les Hauts-de-Seine, directeur artistique de l'ensemble vocal Vox Hominis, directeur musical de l'orchestre Divertimento, chef des chœurs de l'opéra de Nantes, il a par ailleurs enseigné au collège Stanislas de Paris.
Chef du chœur de l'armée française jusqu'en juillet 2000, il a participé pendant près de vingt ans aux grands événements rythmant la vie de la Nation et a dirigé de nombreux concerts en France et à l'étranger.
Chef du chœur du Capitole de Toulouse depuis le 1er septembre 2003, Patrick Marie Aubert est chevalier de l'ordre national du Mérite et officier des Arts et Lettres.
